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• 1、ATAC-seq与CUTTAG都是利用TN5转座体的作用，这两...

ATAC-seq与CUTTAG都是利用TN5转座体的作用，这两...

1、ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing）是一种用于研究染色质开放区域（即易于转录因子和其他蛋白质结合的DNA区域）的技术。ATAC-seq利用一个被称为Tn5转座酶的蛋白质将测序接头插入到活跃的染色质区域，转座酶的作用导致DNA断裂，产生长度不等的DNA片段。

2、要想知道ATAC-seq的作用，首先必须知道染色质的结构，以human为例，有一定molecular biology背景的人都知道，人类的DNA并不是裸露的，长度惊人的DNA链是以一种特殊的结构被“收纳”在细胞中的：DNA缠绕在组蛋白上，形成串珠式的结构。

3、原核生物的转座分为两种方式，复制转座和保守转座。复制转座的供体DNA完整，把通过复制的DNA片段插入基因位点上；保守转座则是从供体DNA上分离一段DNA，以转座酶作为中介，连接到目标DNA上而实现的 (又被成为 cut and paste 转座)。Tn5是极好的模型来研究保守转座模式。

4、ATAC-seq ，英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing。用于研究染色质可及性/开放性的方法。什么是染色质可接近性/开放性？DNA与组蛋白结合后形成核小体，核小体再进一步折叠压缩后最终形成染色质。

5、为同时获得同一细胞的转录组和表观组，10x Genomics单细胞多组学ATAC+基因表达技术首先利用Tn5转座酶对细胞核悬液进行核DNA转座，Tn5转座酶优先切割开放染色质区域中的核DNA。